Significado
Caer mal a una persona o ser enemigo de ella.
Ejemplo
Sé que el profesor me va a suspender, porque me tiene en la lista negra desde el día en que metí el ratón en clase.
Origen
Sabido es que en el lenguaje popular existen muchas expresiones que identifican a lo blanco con lo bueno (dar o tener carta blanca) y a lo negro con lo malo (pasarlas negras, tener la negra). La expresión que nos ocupa es una de estas últimas.
Desde tiempos remotísimos, los mandatarios o personas con poder hacían circular listas de personas que estaban condenadas, que no eran gratas o cuya amistad debía evitarse. Baste citar aquí las de la Inquisición o las franquistas tras la guerra civil.